1995年到山东大学法学院任教（1988年9月至1995年7月，在四川大学法学院先后获得学士、硕士学位；）；

2000年9月破格晋升副教授（2000年8月至2000年12月,作为美国政府USIA项目访问学者赴美国进行学术研修；2001年9月至2004年6月,在北京大学法学院攻读刑法学博士学位，导师陈兴良教授；2004年11月至2007年5月，在中国政法大学法学博士后流动站从事刑事诉讼法学研究，合作导师卞建林教授；）；

2005年9月晋升教授；

2007年6月被聘为博士研究生导师（2007年2月至2007年4,赴北欧、香港进行学术考察和研究）。

曾任山东大学法学院副院长、院学术委员会主任、校社科学部学术委员会委员。

现任山东大学法学院院长。

2019年2月11日，山东省委政法委对第二届山东省法官检察官遴选和惩戒委员会委员候选人进行公示，周长军为候选人。

研究方向为刑事诉讼法学、刑法学、司法制度。

兼任中国法学会刑事诉讼法学研究会理事、山东省诉讼法学研究会副会长、山东省刑法学研究会常务理事、山东大学法学院诉讼法学科带头人。

1、《刑事裁量权论——在划一性与个别化之间》（专著，中国人民公安大学出版社）；

2、《制度与逻辑——刑事诉讼机制的转型分析》（专著，中国方正出版社）；

3、《刑事诉讼的理念》（与左卫民教授合著，法律出版社）；

4、《变迁与改革——法院制度现代化研究》（与左卫民教授合著，法律出版社）；

5、《刑法学》（主编，中国方正出版社）；

6、《全球化语境中的有组织犯罪研究》（4人合著，中国检察出版社）；

7、《中华人民共和国<人民检察院组织法>修改专家意见稿》（参著，中国检察出版社）；

8、《刑法学关键问题》（参著，高等教育出版社）。

在《中外法学》、《法律科学》、《现代法学》、《法学》、《法学评论》、《环球法律评论》、《政治与法律》、《中国刑事法杂志》、《法学论坛》、《人民检察》、《人民司法》、《文史哲》、《江海学刊》、《四川大学学报》、《山东大学学报》等核心期刊以及《刑事法评论》、《诉讼法论丛》等本专业领域以书代刊的、权威性连续出版物中发表专业论文60余篇。其中，《论刑事诉讼的游戏精神》、《刑事侦查阶段的犯罪新闻报道及其限制——基于犯罪嫌疑人人权的分析》、《“坦白从宽”法定化论辨析》、《公诉运行机制的比较研究》、《司法独立新论》、《法人犯罪中责任人员的罪责根据新论》等多篇论文被人大报刊复印资料、《刑法学研究精品集锦》转载或收录。

1、《变迁与改革——法院制度现代化研究》，全国第四届中青年诉讼法学优秀科研成果著作类二等奖（2001年）；

2、《法人犯罪中责任人员的罪责根据新论》，中国法学会刑法学研究会评选的“海南杯世纪优秀论文”二等奖（2000年）；

3、《刑事裁量权论——在划一性与个别化之间》，获全国第一届中青年刑事诉讼法学优秀科研成果著作类三等奖（2007年）；

4、《刑事侦查阶段的犯罪新闻报道及其限制——基于犯罪嫌疑人人权的分析》，获山东省第十六次法学优秀成果一等奖（2007年）。

此外，还获得山东省社会科学优秀成果三等奖、山东高等学校人文社科优秀科研成果三等奖、山东省法学优秀成果三等奖、山东大学社会科学优秀成果三等奖、山东大学“开拓未来奖”、山东大学优秀教学奖等多种奖励。

2012年9月　山东大学第四届“我心目中的好导师”。

1、“刑事裁量权的配置与控约机制研究”，山东省社科基金重大项目，主持人；

2、“恢复性司法理论对我国刑事诉讼制度改革的可能意义”，山东大学青年成长基金项目，主持人；

3、“刑事诉讼法学课程中案例教学法的反思与重构”，山东大学教学改革与研究立项，主持人。

另在参与“反酷刑与中国刑事司法改革”等国家社科基金项目、福特基金会项目、最高人民检察院重大研究课题的研究。